Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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