Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms