Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms