Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLGA3Q08378 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA3Q08378 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms