Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms