Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms