Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN12Q05209 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms