Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms