Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms