Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD1P98174 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms