Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB1P82279 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB1P82279 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms