Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms