Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms