Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGFB2P61812 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFB2P61812 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms