Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2MP61081 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms