Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms