Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MVDP53602 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MVDP53602 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MVDP53602 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MVDP53602 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MVDP53602 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MVDP53602 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MVDP53602 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms