Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms