Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms