Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPAP49450 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPAP49450 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPAP49450 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms