Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms