Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPZBP47756 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms