Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR4P46093 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR4P46093 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR4P46093 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR4P46093 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR4P46093 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR4P46093 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR4P46093 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPR4P46093 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms