Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms