Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT9P35527 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT9P35527 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT9P35527 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT9P35527 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT9P35527 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT9P35527 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT9P35527 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT9P35527 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT9P35527 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT9P35527 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms