Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF2P35227 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms