Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC27P30260 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDC27P30260 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC27P30260 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDC27P30260 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC27P30260 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDC27P30260 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDC27P30260 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC27P30260 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC27P30260 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC27P30260 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms