Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD6P30203 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD6P30203 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD6P30203 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD6P30203 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD6P30203 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD6P30203 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD6P30203 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD6P30203 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD6P30203 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms