Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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