Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB4P28070 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms