Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PLNP26678 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PLNP26678 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PLNP26678 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PLNP26678 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PLNP26678 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PLNP26678 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PLNP26678 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms