Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms