Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT1P21579 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT1P21579 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms