Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRHP20396 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRHP20396 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRHP20396 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRHP20396 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRHP20396 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRHP20396 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRHP20396 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRHP20396 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms