Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms