Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB6P18564 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGB6P18564 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms