Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms