Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB1P16220 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms