Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF35P13682 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF35P13682 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF35P13682 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms