Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT13P13646 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms