Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX5BP10606 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX5BP10606 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX5BP10606 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX5BP10606 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX5BP10606 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX5BP10606 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX5BP10606 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX5BP10606 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX5BP10606 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX5BP10606 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX5BP10606 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX5BP10606 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms