Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms