Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms