Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2P0DI81 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms