Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSLP07711 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSLP07711 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSLP07711 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSLP07711 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSLP07711 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms