Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA3O96018 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA3O96018 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA3O96018 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA3O96018 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA3O96018 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA3O96018 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA3O96018 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA3O96018 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms