Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3O95983 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD3O95983 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD3O95983 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD3O95983 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD3O95983 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD3O95983 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD3O95983 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD3O95983 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD3O95983 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD3O95983 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms