Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYF2O95926 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms