Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN1O94985 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN1O94985 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms