Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLIT2O94813 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLIT2O94813 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms